参考答案：

问题1： 工程招标控制价的主要编制依据如下：
(1)《建设工程工程量清单计价规范》GB 50500--2013；
(2)国家或省级、行业建设主管部门颁发的计价定额和计价方法；
(3)建设工程设计文件及相关资料；
(4)招标文件中的工程量清单及有关要求；
(5)与建设项目相关的标准、规范、技术资料；
(6)相关工程造价信息；
(7)其他的相关资料。
问题2：
(1)招标人改用邀请招标不妥。因为该工程是政府投资的建设工程项目，未经批准不得擅自改变招标方式。
(2)在当地承包商中选择中标人不妥。在公开招标活动中，不得限制或者排斥本地区以外的法人或者其他组织参加投标。
问题3：
还应审查的内容有：
(1)具有独立订立合同的权利；
(2)资金、设备和其他物资设施状况；
(3)审查管理能力，经验、信誉和相应的从业人员情况；
(4)审查投标资格是否有效、财产是否被冻结；
(5)审查近三年是否发生过严重违约及重大工程质量问题；
(6)审查法律法规规定的其他资格条件。
问题4：
(1)招标文件字售时间为3个工作日不妥。《工程建设项目施工招标投标办法》中规定，招标文件出售起止时间最短不得少于5日。
(2)投标保证金为120万元不妥。《工程建设项目施工招标投标办法》中规定，投标保证金不得超过投标总价的2％。
(3)开标后组建评标委员会不妥。根据《评标委员会和评标方法暂行规定》，应在开标前，由招标人负责组建。
(4)项目主管部门主要负责人作为评标专家不妥。根据《评标委员会和评标方法暂行规定》，项目主管部门主要负责人不得担任评标委员会成员。
问题5：
(1)签订合同价比中标价降低2％不妥。合同价格应按中标价确定，招标人和中标人应按招投标文件订立合同，不得再订立背离合同实质内容的其他协议。
(2)招标人在签订合同3周后退还投标保证金不妥。招标人应在签订合同后5日内，向未中标的投标人退还投标保证金。

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相关知识：第四章 建设工程招标投标