A.乙公司因急需流动资金向丙银行借款，甲公司为此借款协议提供保证担保

B.乙公司因存放货物需要，租用甲公司仓库一年，年租金3万元，租金符合市场行情

C.甲、乙公司协商在深圳设立一加工厂

D.甲公司闲置一辆运输车，低价转让给乙公司

正确答案：A、C、D

答案解析:根据规定，关联方，是指本企业的董事、监事、高级管理人员及其近亲属，以及这些人员所有或者实际控制的企业。国家出资企业与关联方的交易应当遵守的规则包括，未经履行出资人职责的机构同意，国有独资企业、国有独资公司不得有下列行为：
（1）与关联方订立财产转让、借款的协议；
（2）为关联方提供担保；
（3）与关联方共同出资设立企业，或者向董事、监事、高级管理人员或者其近亲属所有或者实际控制的企业投资。
选项A、C、D不符合。国有独资企业、国有独资公司、国有资本控股公司不得无偿向关联方提供资金、商品、服务或者其他资产，不得以不公平的价格与关联方进行交易。选项B乙公司租赁甲公司的仓库是支付租金的，不属于无偿，不存在违反法律规定的问题。

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相关知识：第二节 国有资产管理法律制度